Операционные помещения должны быть строго разделены на зоны ограниченного доступа (стерильные операционные), полу-зоны ограниченного доступа (загрязненные операционные) и неограниченные зоны. Существует два варианта разделения этих трех зон: первый — разместить зоны ограниченного и полу-ограниченного доступа на разных этажах, что позволяет обеспечить тщательную гигиеническую изоляцию, но требует двух комплектов помещений, увеличивает штат сотрудников и неудобно для руководства; другой — иметь ограниченные и неограниченные зоны в разных частях одного этажа с полу-ограниченной зоной между ними и совместное использование оборудования. Такая конструкция более удобна для управления.
К зонам ограниченного доступа относятся стерильные операционные, туалеты, стерильные комнаты и помещения для хранения лекарств. К зонам полу-ограниченного доступа относятся комнаты экстренной помощи или загрязненные операционные, помещения для подготовки инструментов и перевязочных материалов, помещения для подготовки к анестезии и стерилизационные помещения. Неограниченные зоны включают раздевалки, комнаты для гипсования, комнаты для образцов, комнаты для сбора отходов, комнаты восстановления после анестезии, кабинеты медсестер, комнаты отдыха для персонала, столовую и комнату отдыха для семей хирургических пациентов. Дежурная комната и кабинеты медицинских сестер должны располагаться недалеко от входа.